مهدی باکری از جمله فرماندهان ارشد سپاه پاسداران به شمار می‌آید که در بیش از ۱۰ عملیات مهم حضور موثر داشت. وی در عملیات‌های فتح‌المبین، بیت‌المقدس، رمضان، مسلم بن عقیل، والفجر مقدماتی، والفجر ۱، ۲، ۳، ۴ و همچنین عملیات خیبر حاضر بو