سهامداران این صندوق پژوهش و فناوری، ستاد توسعه فناوری‌های حوزه اقتصاد دیجیتال و هوشمندسازی معاونت علمی و فناوری ریاست جمهوری، شرکت دانش‌بنیان پارت و چهار نهاد دیگر، از جمله شرکت توسعه سرمایه‌گذاری دانشگاه تهران است.